為符合機場設施使用者付費原則，並考量鄰近標竿機場已向轉機過境旅客收取相關費用，交通部表示，將自3月31日起向每位在桃園國際機場轉機過境旅客收取「轉機過境設施使用費」500元，將由航空公司隨機票代收，收取時間以開票日為準。轉機過境旅客如持有未含該費用之機票，應於辦理轉機過境報到手續時，向航空公司櫃檯補繳；如已繳納費用但未轉機過境者，亦得申請全額退還。因轉機過境旅客是以外國人士為主，收取該費用不致對國人產生影響。
交通部表示，部長王國材於去(111)年11月7日立法院備詢時指示，由桃園機場公司及民航局研議向轉機過境旅客收取相關費用。經機場公司及民航局考量鄰近的日本成田、韓國仁川及新加坡樟宜等標竿機場已向轉機過境乘客收取相關費用，且近年受疫情影響，機場配合執行防疫措施，並運用疫情期間強化機場各項軟硬體設施，增加旅客服務及建設資本支出，規劃向轉機過境旅客收取「轉機過境設施使用費」，並已與航空公司完成前置作業準備工作。
交通部指出，目前向每位出境旅客收取的機場服務費係自58年起實施，以疫情前桃機108年旅客量約4868萬人次，出境旅客約2418萬人次，機場服務費年收入約106億元，並由機場公司與觀光局收取各半。另以同年桃機轉機過境旅客約296萬人次，約占6.1%，其中約有8成來自東南亞往返美加地區，若以桃機108年轉機過境旅客量估算，「轉機過境設施使用費」1年可收取約15億元。
交通部提到，110年疫情嚴峻期間，桃機年旅客量僅約91萬人次，為108年運量的2%。隨邊境開放，各國航空運能、航點陸續恢復，目前桃機國際航線共可連結29個國家地區、63個航點，每周約1400航班，較108年每周約近2300航班，已恢復約6成。桃機1至2月份旅客量為約409萬人次，已達108年同期旅客量的52%，運量已明顯復甦，預估明年旅客量應可超過2000萬人次以上。參考108年轉機過境旅客比例預估，今年我國轉機過境旅客約可達120萬人次以上，其中桃機占比約99%。
交通部表示，在迎接運量復甦的後疫情時代，將持續積極推動桃機第三航廈、第三跑道及高雄國際機場新航廈建設等重大建設，提升旅客服務品質，並透過收取「轉機過境設施使用費」落實使用者付費原則，使機場有相對應之收入持續優化相關軟硬體設施設備，提供旅客更為安全、便捷的服務品質。
