過去台灣市售的養殖文蛤，都被認為是100多年前日本政府引進的麗文蛤，如今農委會水產試驗所透過DNA鑑定發現，這些文蛤其實是台灣原生種，這項研究日前在國際期刊《軟體動物研究》正式發表，國際並正式將文蛤命名為「台灣文蛤」。
據了解，由於麗文蛤和台灣文蛤的外觀非常接近，官方與學界過去均以為台灣文蛤是日本人引進的麗文蛤。不過，水試所4年前接獲淡水區漁會反映，淡水河的文蛤捕撈量逐年下降，還發生暴斃事件，水試所進行文蛤棲地調查及復育工作時，透過分子生物技術檢驗發現台灣文蛤是100%的台灣原生種，與麗文蛤、中國沿岸的中華文蛤、東南亞的普通文蛤都不同。台灣文蛤除分布於台灣沿海，中國南部沿海也有。
水試所推測，日治時期引進的麗文蛤，屬溫帶物種，無法適應台灣亞熱帶氣候，所以當時沒有存活。所以，人們現在吃的文蛤，並非麗文蛤繁衍的後代，而是正港的台灣原生種「台灣文蛤」。此外，淡水河口的文蛤與雲林養殖文蛤外觀看似不同，過去也被以為是不同種類，如今確認是同一品系的台灣原生種，可能是因攝食藻類、生存環境的鹽分濃度影響，才導致外觀有差異。
