運動時補充益生菌是近年來漸漸受到重視的觀點之一，益生菌不僅能幫助維持腸道內好菌存在，更對營養吸收、降低發炎反應、促進肌肉生長與維持等多個面向都有助益。台灣營養微生物學專家與國立體育大學團隊攜手研究，證實特殊益生菌菌株PS128可以降低高強度運動員的運動損傷及疲勞，更能促進運動修復、提升耐力表現。研究成果已發表於國際營養學權威期刊《Nutrients》。
研究發現，鐵人三項運動員在比賽前數周開始使用植物乳桿菌PS128，相較於使用安慰劑，PS128可以顯著降低因運動產生的發炎反應、降低肌肉傷害與肌肉疲勞，更進一步可提升跑步耐力表現以及降低疲勞程度。參與執行此研究案的國立體育大學特聘教授黃啟彰指出，PS128可以提升腸道好菌及支鏈胺基酸濃度，而支鏈胺基酸是運動時消耗最大的胺基酸，有助於平衡肌肉能量代謝，對於提升運動員的訓練成效至關重要。
益生菌除了對運動員肌力、耐力等方面有幫助外，也有國外研究發現，益生菌可降低因運動訓練所出現的上呼吸道感染症狀、幫助平衡免疫系統，降低運動員訓練過程因病中斷機率。澳洲研究團隊發表於英國運動醫學期刊《British Journal of Sports Medicine》的臨床研究指出，給予25名職業運動員連續4周瑞士乳桿菌Lafti L10，發現L10益生菌可以提升運動員唾液中的干擾素γ，幫助過度訓練運動員恢復健康免疫力、維持日常最佳狀態。
除了上述兩種特殊益生菌菌株外，國立陽明交通大學產學講座教授蔡英傑團隊的研究也發現，副乾酪乳桿菌PS23能降低實驗動物因年齡影響的肌肉損失、提升與肌肉合成調控有關的Akt蛋白濃度、幫助提升老化實驗動物肌肉健康。蔡英傑教授表示，近年來科學研究發現腸道菌與身體健康息息相關，現在也證實了「菌-腸-肌肉軸」的存在，也就是腸道菌可以透過降低發炎、免疫平衡等因素，影響肌肉及運動表現。
「長肌肉，減脂肪」已是現在全民運動的目標之一，在骨骼肌功能、生長和發育中，腸道菌相的豐富性會影響肌肉質量，而在日常生活中想增加腸道菌相豐富度、間接幫助運動表現該怎麼做呢？蔡英傑教授分享：「透過改善飲食或補充益生菌，是增加腸道菌相豐富度最直接的方式之一。」此外像是運動員時常挑戰自我極限、運動量大加上長期密集訓練，強大的心理壓力外也可能導致身體慢性發炎、影響睡眠及免疫力，連帶影響運動表現，因此能抗疲勞、有助維持身體質量的營養品也是他們非常需要補充的一環，只要維持好日常保健的習慣，為腸道留住豐富好菌，就能藉由飲食吃出運動健康與活力。
