因應氣候變遷的挑戰及社會環境的轉變，原農田水利會自109年10月改制納入公務體系，成立農田水利署，這3年來，讓原農田水利會灌區外的農民有水可用，並強化設施巡檢及清淤機制，提高管理量能及效率，同時，建立公開透明制度，增加建設經費，加速改善老舊設施，提高農業水資源韌性，不僅提升作物產量及品質，增加農民收益，也優化民眾生活環境，有效促進農業永續發展。
農業部說明，臺灣的地形特殊，山高、坡陡、流急，如果沒有良好的取水、輸水、蓄水、配水設施，一下雨，水很容易直接川流入海，等到作物需要水的時候，就無水可灌溉。因此，健全的農田水利設施及良好的灌溉管理服務是農業永續發展的基礎。然而，過往農田水利會為公法人，屬會員制，僅提供灌溉水給灌區內的農民，而灌區外的農民，就很容易遭受缺水之苦。
農水署自109年10月成立後，立即針對全國原農田水利會灌區外水資源、農地使用情形、地形地貌等進行調查評估作業，擬定蓄豐濟枯、引水廣佈、取清防污、智慧灌溉、永續共好等五大策略，依據各地不同的水源、地形、作物等特性，制定不同的建設計畫，克服當地不同的挑戰，施作不同的灌溉設施，讓農民有水可以灌溉。經過3年的努力，目前累計受益面積已達5.6萬多公頃，受益農戶達8萬餘戶，這是過去農田水利會數十年來都沒有辦法做到的事情，改制成果非常豐碩。
農業部指出，臺灣圳路長約7萬餘公里，構造物約20餘萬座，農田水利設施密度為世界最高，農水署平時就進行各項設施檢查作業，確保圳路輸水通暢及閘門啟閉正常，平時農民遇有異物掉落渠道或水路阻塞的情形，亦可隨時就近向農水署各地管理處之工作站反映，由第一線同仁立即進行清淤作業，今年5月更新增民眾免付費通報專線0800-788717(請幫忙清一清)及圳路清淤通報網(https://www.channelmm.ia.gov.tw)，強化清淤通報機制。
農田水利會改制前，平均每年清淤量為159萬立方公尺，清淤案件平均處理時間為8.2天；改制後，平均每年清淤量提升至253萬立方公尺，清淤案件平均處理時間縮短至4.6天，清淤量能及效率均大幅提升。由於農水署持續精進圳路閘門巡檢作業，並強化清淤量能及效率，故今年歷經海葵、小犬等颱風來襲，均無發生農田水利災害。
農業部說明，為因應氣候變遷的挑戰，強化農田水利設施韌性，農水署成立以後，立即針對全國原農田水利會各灌溉系統進行全面調查評估，並研擬系統性改善計畫，建設經費由110年的41億元，至111年成長為52億元，112年更大幅增加至136億元，讓過去重要卻遲未改善的設施，諸如：進水口、渠首工、調蓄池、倒虹吸工、渡槽、輸水隧道、幹線等得以改善。這3年來，積極改善老舊取水、輸水、蓄水、配水等設施，有效增進這些重要基礎設施的結構安全及運轉效能，並擴增農業水資源年調蓄量能達6,600萬立方公尺，有效提升農業水資源調適氣候變遷之韌性。
此外，農水署各地管理處輔導農民在其田間設置管路灌溉設施，讓農民灌溉更加精準、方便，並提高用水效率，平均節水率可達20%以上，同時，作物產量及品質也得以提升，深獲農民肯定及讚許。為積極推廣管路灌溉設施，提高農業用水效率，並增進農民的田間抗旱能力，明(113)年1月1日起，將提高補助額度，每戶農民每年最高補助由40萬元提高至每年50萬元，農民如有需求可洽該署各地管理處申辦。
農業部進一步說明，農水署成立後，立即邀集相關機關、專家學者等，制定相關典章制度，並加強教育訓練，使全國各地管理處員工以公開、公正、公平、透明的作業方式，辦理各項農田水利業務。在健全的制度下，農水署成立短短3年內，即榮獲國家永續發展獎、國家卓越建設獎、公共工程金質獎、優良農業建設工程獎、資誠永續影響力獎等多方肯定。另一方面，改制前農田水利會人員多達257人遭法院判決有罪；改制後，迄今無人遭法院判刑，連遭地檢署起訴都沒有，顯見農田水利改革，不論在興利或防弊，皆卓然有成。
農業部進一步表示，農水署近年來在建置灌溉系統或改善農田水利設施的同時，也會善用隙地，透過植樹、環境整理等方式，營造良好的親水空間，優化附近居民的生活環境。因此，改制後的農田水利事業，不僅提升農作物產量及產值，增加農民的收益，同時也發揮滋潤大地，調節微氣候，補注地下水，豐富農村景觀，優化民眾生活環境的功能，嘉惠對象由農民延伸至全民。
農業部強調，農田水利會改制納入公務體系，即是政府整體施政之一環，更受民意機關乃至全體國民之監督，改制迄今3年，各項成效已陸續呈現，未來將持續深化改革，期盼各界持續支持農田水利各項革新工作。
農業部代理部長陳駿季表示，水利會受限於原來組織的關係，服務的都是灌區內的，更重要的是17個農田水利會是各自獨立的，但是一條圳路不會到了某一個水利會就停了，到另一個水利會又重新開始，所以往往沒有辦法順利做整體的規劃。而農田水利會改制成農水署有三個重要意義，第一，我們有擴大的灌溉服務，第二，農田水利建設經費也增加，像今年的疫後特別預算就另外提供了70億，修繕建設農水路，第三，所有的人事公開、透明，所有的制度都是公開透明的，都是為了讓水資源更有效的調度和運用，擴大服務農民。
